La Investidura como Doctor "Honoris Causa" es la máxima distinción que la Universidad de Málaga concede a una persona en reconocimiento a su trayectoria científica, humanística y en general de unos valores que se identifican con el espíritu y la esencia de la institución universitaria. Es un acto académico solemne que sigue exactamente la tradición clásica de incorporación de nuevos doctores al Claustro. Está presidido por el/la Rectora de la Universidad de Málaga y a él asisten personalidades relevantes de la vida social. Se abre con la Laudatio del Padrino del Nuevo Doctor, que seguidamente es investido por la el/ la Rectora y le concede la palabra. Finalmente, la Rectora cierra el acto con un discurso de felicitación. Al finalizar el discurso de la Rectora, se interpreta el Gaudeamus Igitur.

Las Investiduras de Nuevos Doctores tienen lugar por la festividad de Santo Tomás y se celebró por vez primera en 2006, año en que deja de formar parte del acto de Apertura de Curso. Desde entonces, pasó a tener un protocolo propio, conforme a la tradición.
Es un acto solemne restringido a la comunidad universitaria en el que el Rector o la Rectora de la Universidad de Málaga, que preside el acto, va imponiendo birretes a los nuevos doctores en presencia del Vicerrector con competencias en la materia. Al finalizar la imposición de birretes, uno de los nuevos doctores prestará juramento en nombre de sus compañeros. Al final, se interpreta el Gaudeamus Igitur.